一个研究小组通过刺激两种表观遗传因子，提高了用体细胞核移植方法克隆的小鼠的生存能力，并通过这样做表明，要更有效地创造克隆动物，需要在表观遗传领域做进一步的工作。他们还发现了一个关键的表观遗传学机制，似乎是胚胎植入后发育的主要障碍。

克隆动物如绵羊多莉是通过一种称为体细胞核移植( SCNT )的过程产生的，在这种过程中，含有个体DNA的正常体细胞核被移植到已被重新编程为细胞的卵细胞中。如果一切顺利，捐赠人的基因*相同的克隆就会被创造出来，但事情通常不会顺利。例如，在多利的情况下，在个胎儿成功受孕之前，必须手动进行277次以上的手术。

近，包括RIKEN科学家在内的研究小组得出结论，表观遗传因子( DNA或组蛋白的化学修饰而不是遗传密码本身的变化)在阻碍克隆的正常发育方面起着关键作用。首先，一种称为组蛋白H3赖氨酸9*基化的表观遗传因子被发现是重新编程的SCNT胚胎正常发育的一个重要障碍，通过注射一种称为kdm4d的去甲基化因子去除这一因子提高了克隆胚胎的成功植入率。其次，一种叫做exist的RNA，通常只从父系X染色体表达，在SCNT中从两个X染色体表达，导致植入后发育问题。由于这两种障碍，小鼠中只有大约1 %的SCNT胚胎能够成功受孕。

在目前发表于inCell Stem Cell的实验中，研究人员将这两种方法结合起来，使用现有基因被敲除的细胞，然后注射Kdm4d信使RNA。使用这种联合方法，大约20 %的植入细胞达到足月。

这项研究还发现，即使胚胎移植成功，它们也经常出现异常，阻碍它们正常发育，胎盘本身也存在异常。进一步的研究表明，虽然受精胚胎和SCNT胚胎表观遗传标记的总体水平相似，但通过甲基化沉默的特定基因存在差异。此外，科学家还发现了一组特殊的基因，这些基因不是从受精胚胎的母体染色体上表达的，而是从SCNT胚胎的父本染色体和母体染色体上表达的。已知这些基因参与胎儿和胎盘的发育，为植入后发育失败提供了可能的解释。。

根据RIKEN生物资源研究中心的Shogo Matoba，这项研究的作者，“通过这项工作，我们已经明确地表明表观遗传修饰将需要被调节以进一步提高SCNT的效率。我们已经取得了很好的进展，并且还发现了一组关键的基因，我们认为，这些基因阻碍了胎儿在植入后的正常发育。我们将继续研究如何克服这一进一步的障碍，希望能提高克隆的效率。"